"Kelas E" dari Kunugigaoka SMP terdiri dari siswa bertekad untuk tidak punya masa depan. Mereka dipisahkan dari teman-teman sekelas mereka dan ditugaskan untuk tentacled guru wali kelas alien aneh. Orang asing, siapa siswa sebut sebagai "Kurosensei" (harfiah "guru unkillable"), yang sebelumnya telah menghancurkan sebagian besar bulan dan mengancam akan menghancurkan bumi. Namun, ia memutuskan untuk menunda rencananya untuk satu tahun jika ia diberi kelas siswa SMP untuk mengajar dengan syarat bahwa ia tidak akan menyakiti mereka.

Kurosensei guru kelas berbagai teknik pembunuhan dan pemerintah menjanjikan hadiah 1 milyar yen kepada siswa yang akhirnya berhasil membunuhnya. Sayangnya, Kurosensei mampu menghindari semua serangan mereka karena refleks alien jauh atasannya. Meskipun ini, mahasiswa Nagisa Shiota melacak setiap kelemahan yang dirasakan saat ia dan teman-teman sekelasnya mencoba untuk datang dengan cara-cara baru untuk membunuhnya.