"Puputan" menceritakan tentang I Gusti Ngurah Made Agung, Raja Badung yang berjuang untuk mempertahankan kedaulatan kerajaannya dari penjajahan Belanda. Dalam perjuangannya itu, ia harus menghadapi J. Eschbach, Residen Belanda yang mendapat perintah dari Gubernur Belanda di Batavia, J.B. Van Heutz untuk menaklukkan Kerajaan Badung. Pada akhirnya, tentara Belanda mendatangi Kerajaan Badung dan menggempurnya hingga habis. Sampai di titik akhir, Made Agung tak pernah mundur sedikit pun. Ia tetap berjuang memimpin rakyatnya untuk melakukan Perang Puputan, perang hingga titik darah penghabisan.